เยื่อบุตาอักเสบจากภูมิแพ้เกิดจากการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันที่ผิดปกติของเยื่อบุตาอักเสบต่อสารก่อภูมิแพ้
สารก่อภูมิแพ้ที่พบบ่อย ได้แก่ สะเก็ดผิวหนังของสัตว์ ไรฝุ่น ฝุ่น ละอองเกสรดอกไม้ ฯลฯ ผู้ที่เป็นโรคภูมิแพ้อาจปรากฏขึ้นได้เมื่อสัมผัสด้วยอาการคันตา มีสารคัดหลั่งเพิ่มขึ้น ฉีกขาดง่าย เป็นต้น
